После того, как я настроил себе Compiz во имя прозрачностей, JACK стал выдавать какие-то посторонние трески и шумы. Не знаю, с чем это могло быть связано, но факт был. Ковырял настройки, не помогло. Отчаявшись, завёл себе JACK2. Шумы сразу же исчезли, всё работает, JACK жив. Правда, видимо, от запуска при загрузке придётся отказаться - видимо, скрипт из джентувики специфичен для JACK1.

Методом тыка нашёл конфигурацию для JACK, теперь QJackCtrl запускает демон, не отрубает его тут же и не виснет сам (я сократил "количество периодов в аппаратном буфере" до минимума - но если б я ещё понимал, что это такое). Меж тем запуск JACK при старте системы не работает. Сделал так, как написано в англоязычной джентувике, сам по себе скрипт работает, и даже запускается при старте, но звука с приложений JACK не даёт до тех пор, пока не перезапустишь его вручную. Собственно, вот статья в джентувике: http://en.gentoo-wiki.com/wiki/JACK#Star....._boot_time

QJackCtl не сохраняет настройки в ~/.jackdrc, не знаю, что с этим делать. Интересно, куда он их в принципе тогда сохраняет.